Le système de qualifications pour le Daytona 500 est complexe: les qualifications qui ont eu lieu dimanche n'assuraient qu'aux deux premiers leurs positions sur la grille. Jimmie Johnson savait donc qu'il serait en pole devant Michael Waltrip.
Les autres pilotes devaient se départager lors des deux courses de 150 miles organisées jeudi, le Gatroade Duel. L'ordre d'arrivée de la première course définissait les places impaires sur la grille (donc la ligne intérieure au départ), et le classement de la seconde course définissait les places paires (la ligne extérieure).
Lors de la première course, c'est Dale Earnhardt Jr qui s'est imposé. Il est irrésistible depuis son arrivée chez Hendrick Motorsports et sa victoire au Budweiser Shoutout. "Junior" a devancé à l'arrivée Reed Sorenson, Ryan Newman et Casey Mears.
Dans le seconde course, Denny Hamlin a offert à Toyota sa toute première victoire en Cup, devant son équipier Tony Stewart, prouvant à nouveau que Joe Gibbs Racing s'est très rapidement adapté à la Camry. Jeff Gordon a terminé troisième, devant Kasey Kahne.
Johnson est donc en pole du Daytona 500 devant Waltrip, Earnhardt Jr, Hamlin, Sorenson, Stewart, Newman et Gordon.
Sur la grille de départ finale, Juan-Pablo Montoya est à une bonne quinzième place, devant Kevin Harvick. Sam Hornish Jr a réussi ses débuts dans le championnat en se qualifiant 19ème.
Ces courses ont été plus difficiles pour les autres anciens pilotes de monoplaces. Patrick Carpentier a percuté le mur, et Jacques Villeneuve s'est accroché avec Dario Franchitti. Le champion du monde 1997 de F1 ne sera pas au départ, mais le champion en titre de l'IndyCar sera bien présent, à la 40ème place.